root/BH13SPARQLBuilder/src/org/biohackathon/SPARQLBuilder/OWL/OWLQueryBuilderImpl.java @ 36

リビジョン 36, 27.7 KB (コミッタ: nori, 11 年 前)

SPARQLクエリの整形
  • 属性 svn:mime-type の設定値 text/plain
行番号 
1package org.biohackathon.SPARQLBuilder.OWL;
2
3import java.util.ArrayList;
4import java.util.Collection;
5import java.util.HashMap;
6import java.util.HashSet;
7import java.util.Set;
8
9import com.hp.hpl.jena.query.Query;
10import com.hp.hpl.jena.query.QueryExecution;
11import com.hp.hpl.jena.query.QueryExecutionFactory;
12import com.hp.hpl.jena.query.QueryFactory;
13import com.hp.hpl.jena.query.QuerySolution;
14import com.hp.hpl.jena.query.ResultSet;
15import com.hp.hpl.jena.rdf.model.Literal;
16import com.hp.hpl.jena.rdf.model.Resource;
17
18/**
19 * 繧ｯ繧ｨ繝ｪ繧堤函謌舌☆繧九◆繧√�讖溯�繧呈署萓帙☆繧区ｸ繧ｯ繝ｩ繧ｹ
20 *
21 * @author Norio KOBAYASHI
22 * @since 28.01.2014
23 * @version 29.01.2014
24 */
25public class OWLQueryBuilderImpl implements OWLQueryBuilder {
26
27        // private Model model = null;
28        private String endpointURI = null;
29
30        /**
31         * 繧｢繧ｯ繧ｻ繧ｹ縺吶ｋSPARQL endpoint縺ｮURI繧呈欠螳壹☆繧区ｧ区�蟄�
32         *
33         * @param endpointURI
34         *            縲€繧｢繧ｯ繧ｻ繧ｹ縺吶ｋSPARQL endpoint縺ｮURI
35         * @throws Exception
36         * @since 28.01.2014
37         */
38        public OWLQueryBuilderImpl(String endpointURI) {
39                this.endpointURI = endpointURI;
40        }
41
42        /**
43         * 繝�せ繝医↓菴ｿ逕ｨ縺吶ｋmain繝｡繧ｽ繝�ラ
44         * <p>
45         * 繧ｯ繧ｨ繝ｪ繝薙Ν繝€繝ｼ縺ｮ譛ｬ逡ｪ繝励Ο繧ｰ繝ｩ繝縺ｧ縺ｯ縺薙�繝｡繧ｽ繝�ラ縺ｯ菴ｿ逕ｨ縺励↑縺�
46         * </p>
47         *
48         * @param args
49         *            菴ｿ逕ｨ縺励↑縺�
50         * @throws Exception
51         * @since 28.01.2014
52         */
53        public static void main(String[] args) throws Exception {
54                // String sparqlEndpoint = "http://dbpedia.org/sparql";
55                String sparqlEndpoint = "http://lsd.dbcls.jp/sparql";
56                // String keyword = "artiste";
57                String keyword = "EnglishCode";
58                String[] graphURIs = new String[0];
59
60                keyword = null;
61
62                OWLQueryBuilder builder = new OWLQueryBuilderImpl(sparqlEndpoint);
63                SClass[] clz = builder.getOWLClasses(graphURIs, keyword, false);
64                for (SClass cls : clz) {
65                        System.out.println(cls);
66                }
67                clz = builder.countInstances(null, clz);
68                for (SClass cls : clz) {
69                        System.out.println(cls);
70                }
71
72                System.out.println("CLS");
73
74                ClassLink[] cls = builder.getNextClass(null, clz[0].getClassURI(), 100,
75                                false);
76                if (cls != null) {
77                        for (ClassLink cl : cls) {
78                                System.out.println(cl.toString());
79                        }
80                        cls = builder.countLinks(null, clz[0].getClassURI(), cls);
81                        for (ClassLink cl : cls) {
82                                System.out.println(cl.toString());
83                        }
84                }
85
86                System.out.println("CLS-INS");
87                cls = builder.getNextClassViaInstanceLink(null, clz[0].getClassURI(),
88                                100);
89                if (cls != null) {
90                        for (ClassLink cl : cls) {
91                                System.out.println(cl.toString());
92                        }
93                }
94
95                System.out.println("Instances");
96                Instance[] ins = builder.getInstances(null, "\"A.C. Reed\"@en");
97                if (ins != null) {
98                        for (Instance in : ins) {
99                                System.out.println(in.toString());
100                        }
101                }
102
103                /*
104                 * System.out.println("INS-INS"); ins = builder.getInstances(null,
105                 * "\"A.C. Reed\"@en"); InstanceLink[] iLinks =
106                 * builder.getNextInstancesViaInstanceLink(null,
107                 * ins[0].getInstanceURI(), 100);
108                 *
109                 * if (iLinks != null) { for (InstanceLink in : iLinks) {
110                 * System.out.println(in.toString()); } }
111                 */
112        }
113
114        /**
115         * 譏守､ｺ逧�↓RDF縺ｧ譖ｸ縺九ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧貞叙蠕励☆繧�
116         * <p>
117         * 謖�ｮ壹＆繧後◆graphURIs縺ｮ荳ｭ縺九ｉ縲√く繝ｼ繝ｯ繝ｼ繝峨↓繝偵ャ繝医☆繧九Λ繝吶Ν繧呈戟縺､繧ｯ繝ｩ繧ｹ��dfs:Class�峨ｒ縺吶∋縺ｦ霑斐☆ <br>
118         * </p>
119         *
120         * @param graphURIs
121         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� (null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
122         * @param keyword
123         *            ��ull繧�ｩｺ譁�ｭ励�荳榊庄��
124         * @return 繧ｯ繝ｩ繧ｹURI縺ｮ驟榊�
125         * @throws Exception
126         * @since 28.01.2014
127         */
128        public SClass[] getOWLClasses(String[] graphURIs, String keyword,
129                        boolean countInstances) throws Exception {
130                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
131                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
132                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
133                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
134                if (countInstances) {
135                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?c ?pLabel (COUNT(?i) AS ?numOfInstances)\n");
136                } else {
137                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?c ?pLabel \n");
138                }
139                if (graphURIs != null) {
140                        for (String graphURI : graphURIs) {
141                                queryStr.append("FROM <");
142                                queryStr.append(graphURI);
143                                queryStr.append(">\n");
144                        }
145                }
146                queryStr.append("WHERE{\n");
147
148                queryStr.append(" {?c rdf:type rdfs:Class} UNION {?c rdf:type owl:Class}\n");
149//              queryStr.append("  ?i rdf:type ?c.\n");
150
151
152               
153                if (countInstances) {
154                        queryStr.append("  ?c rdfs:label ?label.\n");
155                }
156                queryStr.append("  ?c rdfs:label ?pLabel.\n");
157                if (countInstances) {
158                        queryStr.append("      ?i rdf:type ?c.\n");
159                }
160                // queryStr.append("      ?c rdfs:label ");
161                // queryStr.append(keyword);
162                // queryStr.append(".");
163                if (keyword != null && keyword.length() != 0) {
164                        queryStr.append("  FILTER (\n");
165                        queryStr.append("    REGEX( ?label , \"");
166                        queryStr.append(keyword);
167                        queryStr.append("\" , \"i\" )\n");
168                        queryStr.append("  )\n");
169                }
170                if (countInstances) {
171                        queryStr.append("}  GROUP BY ?c ?pLabel");
172                } else {
173                        queryStr.append("}");
174                }
175                System.out.println(queryStr.toString());
176
177                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
178                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
179                                query);
180
181                ResultSet results = qexec.execSelect();
182                HashMap<String, SClass> classMap = new HashMap<String, SClass>();
183                for (; results.hasNext();) {
184                        QuerySolution sol = results.next();
185                        Resource res = sol.getResource("c");
186                        if (res != null) {
187                                String uri = res.getURI();
188                                int numOfInstances = 0;
189                                if (countInstances) {
190                                        numOfInstances = sol.getLiteral("numOfInstances").getInt();
191                                }
192                                // System.out.println(numOfInstances);
193                                Literal labelLiteral = sol.getLiteral("pLabel");
194                                SClass sClass = null;
195                                if (classMap.containsKey(uri)) {
196                                        sClass = classMap.get(uri);
197                                } else {
198                                        sClass = new SClass(uri, null, numOfInstances);
199                                        classMap.put(uri, sClass);
200                                }
201                                if (labelLiteral != null) {
202                                        String label = labelLiteral.getString();
203                                        String lang = labelLiteral.getLanguage();
204                                        sClass.addLabel(new Label(label, lang));
205                                }
206                        }
207                }
208                qexec.close();
209                return classMap.values().toArray(new SClass[0]);
210        }
211
212        /**
213         * 縲€繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ繧貞叙蠕励☆繧�
214         * <p>
215         * 謖�ｮ壹＆繧後◆graphURIs縺ｮ荳ｭ縺九ｉ縲√く繝ｼ繝ｯ繝ｼ繝峨↓繝偵ャ繝医☆繧九Λ繝吶Ν繧呈戟縺､繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ繧偵☆縺ｹ縺ｦ霑斐☆ <br>
216         * 縺薙％縺ｧ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ縺ｯ縲〉df:type縺ｮ荳ｻ隱槭→縺励※險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ゅ�繧偵＞縺�<br>
217         * </p>
218         *
219         * @param graphURIs
220         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� (null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
221         * @param keyword
222         *            ��ull繧�ｩｺ譁�ｭ励�荳榊庄��
223         * @return 繧ｯ繝ｩ繧ｹURI縺ｮ驟榊�
224         * @throws Exception
225         * @since 28.01.2014
226         */
227        public Instance[] getInstances(String[] graphURIs, String keyword)
228                        throws Exception {
229                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
230                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
231                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
232                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
233                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?ins ?c \n");
234                if (graphURIs != null) {
235                        for (String graphURI : graphURIs) {
236                                queryStr.append("FROM <");
237                                queryStr.append(graphURI);
238                                queryStr.append(">\n");
239                        }
240                }
241                queryStr.append("WHERE{\n");
242                // queryStr.append(" {?c rdf:type rdfs:Class} UNION {?c rdf:type owl:Class}\n");
243
244                queryStr.append("      ?ins rdf:type ?c.\n");
245                queryStr.append("      ?ins rdfs:label ");
246                queryStr.append(keyword);
247                queryStr.append(".\n");
248                queryStr.append(" FILTER (?c != rdf:Property)");
249                queryStr.append("}");
250
251                // System.out.println(queryStr.toString());
252
253                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
254                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
255                                query);
256
257                ResultSet results = qexec.execSelect();
258                HashMap<String, HashSet<String>> instanceMap = new HashMap<String, HashSet<String>>();
259                for (; results.hasNext();) {
260                        QuerySolution sol = results.next();
261                        Resource cls = sol.getResource("c");
262                        Resource ins = sol.getResource("ins");
263                        String clsURI = cls.getURI();
264                        String insURI = ins.getURI();
265                        if (instanceMap.containsKey(insURI)) {
266                                HashSet<String> classes = instanceMap.get(insURI);
267                                classes.add(clsURI);
268                        } else {
269                                HashSet<String> classes = new HashSet<String>();
270                                instanceMap.put(insURI, classes);
271                                classes.add(clsURI);
272                        }
273                }
274                qexec.close();
275                Set<String> keySet = instanceMap.keySet();
276                ArrayList<Instance> instanceList = new ArrayList<Instance>();
277                for (String key : keySet) {
278                        Instance ins = new Instance(key, instanceMap.get(key).toArray(
279                                        new String[0]));
280                        instanceList.add(ins);
281                }
282                return instanceList.toArray(new Instance[0]);
283        }
284
285        /**
286         * 縲€謖�ｮ壹＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧定ｵｷ轤ｹ縺ｨ縺励€∵�遉ｺ逧�↓險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋOWL縺ｮproperty蛻ｶ邏�ｒ隱ｿ縺ｹ縲√◎縺ｮproperty蛻ｶ邏�〒
287         * 髢｢騾｣縺･縺代ｉ繧後※縺�ｋ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧堤ｶｲ鄒�噪縺ｫ蜿門ｾ励☆繧�
288         * <p>
289         * 蜃ｦ逅�ｯｾ雎｡繝��繧ｿ繧暖raphURIs縺ｧ謖�ｮ壹☆繧九％縺ｨ縺後〒縺阪ｋ <br>
290         * <br>
291         * </p>
292         *
293         * @param graphURIs
294         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� 縲€(null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
295         * @param originClass
296         *            襍ｷ轤ｹ縺ｨ縺ｪ繧九け繝ｩ繧ｹ縺ｮURI縲€��ull荳榊庄��
297         * @param limit
298         *            隗｣縺ｨ縺励※霑斐＆繧後ｋClassLink驟榊�縺ｮ髟ｷ縺輔�荳企剞蛟､繧呈欠螳壹☆繧九€�荳企剞蛟､繧定ｨｭ螳壹＠縺ｪ縺�ｴ蜷医�0莉･荳九�蛟､繧呈欠螳壹☆繧�
299         * @return ClassLink縺ｮ驟榊�縲ゅ％縺薙↓縺ｯ縲∝叙蠕励＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｨ髢｢菫ゅ▼縺代ｉ繧後※縺�ｋ繝励Ο繝代ユ繧｣縲�未菫ゅ�蜷代″縺悟性縺ｾ繧後ｋ縲�
300         * @throws Exception
301         * @since 28.01.2014
302         */
303        public ClassLink[] getNextClass(String[] graphURIs, String originClass,
304                        int limit, boolean countLinks) throws Exception {
305                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
306                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
307                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
308                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
309
310                // SELECT
311                if (countLinks) {
312                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?p ?pDirection ?c (COUNT(?s) AS ?numOfLinks) \n");
313                } else {
314                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?p ?pDirection ?c \n");
315                }
316
317                if (graphURIs != null) {
318                        for (String graphURI : graphURIs) {
319                                queryStr.append("FROM <");
320                                queryStr.append(graphURI);
321                                queryStr.append(">\n");
322                        }
323                }
324                queryStr.append("WHERE{\n");
325                // queryStr.append("  { ?c rdf:type rdfs:Class. }\n  UNION\n  { ?c rdf:type owl:Class. }\n");
326                queryStr.append("  { ?p rdfs:domain <");
327                queryStr.append(originClass);
328                queryStr.append(">.\n    ?p rdfs:range ?c.\n");
329
330                if (countLinks) {
331                        queryStr.append("    ?o ?p ?s.");
332                } else {
333                        queryStr.append("filter(exists{\n");
334                        queryStr.append("  ?o rdf:type ?c.\n");
335                        queryStr.append(" ?s rdf:type <");
336                        queryStr.append(originClass);
337                        queryStr.append(">.\n");
338                        queryStr.append("       ?s ?p ?o.})\n");
339                }
340
341                queryStr.append("}\n  UNION\n");
342                queryStr.append("  { ?p rdfs:range <");
343                queryStr.append(originClass);
344                queryStr.append(">.\n");
345                queryStr.append("    ?p rdfs:domain ?c.\n");
346
347                if (countLinks) {
348                        queryStr.append("    ?s ?p ?o.");
349                } else {
350                        queryStr.append("filter(exists{\n");
351                        queryStr.append("  ?s rdf:type ?c.\n");
352                        queryStr.append(" ?o rdf:type <");
353                        queryStr.append(originClass);
354                        queryStr.append(">.\n");
355                        queryStr.append("       ?s ?p ?o.})\n");
356                }
357
358                queryStr.append("}\n");
359
360                queryStr.append("    ?p ?pDirection ?c.\n");
361
362                queryStr.append("  ?s rdf:type ?c.\n");
363
364                if (countLinks) {
365                        queryStr.append("}\nGROUP BY ?p ?pDirection ?c\n");
366                } else {
367                        queryStr.append("}\n");
368                }
369                if (limit > 0) {
370                        queryStr.append("limit ");
371                        queryStr.append(limit);
372                        queryStr.append("\n");
373                }
374
375                System.out.println(queryStr.toString());
376
377                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
378                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
379                                query);
380
381                ResultSet results = qexec.execSelect();
382                ArrayList<ClassLink> solCLs = new ArrayList<ClassLink>();
383                for (; results.hasNext();) {
384                        QuerySolution sol = results.next();
385                        Resource pro = sol.getResource("p");
386                        if (pro != null) {
387                                Resource cls = sol.getResource("c");
388                                Resource dir = sol.getResource("pDirection");
389                                String proURI = pro.getURI();
390                                String clsURI = cls.getURI();
391                                String dirURI = dir.getURI();
392
393                                // System.out.println(pro.getURI() + " " + cls.getURI() + " " +
394                                // dir.getURI());
395
396                                Direction direction = null;
397                                if (dirURI
398                                                .equals("http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#domain")
399                                                || dirURI.equals("rdfs:domain")) {
400                                        direction = Direction.reverse;
401                                }
402                                if (dirURI.equals("http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#range")
403                                                || dirURI.equals("rdfs:range")) {
404                                        if (direction != null) {
405                                                direction = Direction.both;
406                                        } else {
407                                                direction = Direction.forward;
408                                        }
409                                }
410                                // System.out.println(direction);
411                                int numOfLinks = 0;
412                                if (countLinks) {
413                                        numOfLinks = sol.getLiteral("numOfLinks").getInt();
414                                }
415                                ClassLink cl = new ClassLink(proURI, clsURI, direction,
416                                                numOfLinks);
417                                solCLs.add(cl);
418                        }
419                }
420                qexec.close();
421                return solCLs.toArray(new ClassLink[0]);
422        }
423
424        /**
425         * 縲€謖�ｮ壹＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧定ｵｷ轤ｹ縺ｨ縺励€√◎縺ｮ繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｫ螻槭＠縺ｦ縺�ｋ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ繝ｪ繝ｳ繧ｯ縺悟ｼｵ繧峨ｌ縺ｦ縺�ｋ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ髮�粋繧貞叙蠕励＠縲�
426         * 蜿門ｾ励＠縺溘う繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧堤ｶｲ鄒�噪縺ｫ蜿門ｾ励☆繧�
427         * <p>
428         * 縺薙％縺ｧ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ縺ｯ縲〉df:type縺ｮ荳ｻ隱槭→縺励※險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ゅ�繧偵＞縺�<br>
429         * 蜃ｦ逅�ｯｾ雎｡繝��繧ｿ繧暖raphURIs縺ｧ謖�ｮ壹☆繧九％縺ｨ縺後〒縺阪ｋ <br>
430         * </p>
431         *
432         * @param graphURIs
433         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� 縲€(null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
434         * @param originClass
435         *            襍ｷ轤ｹ縺ｨ縺ｪ繧九け繝ｩ繧ｹ縺ｮURI縲€��ull荳榊庄��
436         * @param limit
437         *            隗｣縺ｨ縺励※霑斐＆繧後ｋClassLink驟榊�縺ｮ髟ｷ縺輔�荳企剞蛟､繧呈欠螳壹☆繧九€�荳企剞蛟､繧定ｨｭ螳壹＠縺ｪ縺�ｴ蜷医�0莉･荳九�蛟､繧呈欠螳壹☆繧�
438         * @return ClassLink縺ｮ驟榊�縲ゅ％縺薙↓縺ｯ縲∝叙蠕励＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｨ髢｢菫ゅ▼縺代ｉ繧後※縺�ｋ繝励Ο繝代ユ繧｣縲�未菫ゅ�蜷代″縺悟性縺ｾ繧後ｋ縲�
439         * @throws Exception
440         * @since 28.01.2014
441         */
442        public ClassLink[] getNextClassViaInstanceLink(String[] graphURIs,
443                        String originClass, int limit) throws Exception {
444                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
445                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
446                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
447                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
448                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?pf ?pr ?c \n");
449                if (graphURIs != null) {
450                        for (String graphURI : graphURIs) {
451                                queryStr.append("FROM <");
452                                queryStr.append(graphURI);
453                                queryStr.append(">\n");
454                        }
455                }
456                queryStr.append("WHERE{\n");
457                queryStr.append("  ?ins rdf:type ?c.\n");
458                queryStr.append("  ?insOrg rdf:type <");
459                queryStr.append(originClass);
460                queryStr.append(">.\n");
461                queryStr.append("  { ?ins ?pr ?insOrg. }\n  UNION { ?insOrg ?pf ?ins. }\n");
462                queryStr.append("}\n");
463                if (limit > 0) {
464                        queryStr.append("limit ");
465                        queryStr.append(limit);
466                        queryStr.append("\n");
467                }
468
469                // System.out.println(queryStr.toString());
470
471                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
472                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
473                                query);
474
475                ResultSet results = qexec.execSelect();
476                ArrayList<ClassLink> solCLs = new ArrayList<ClassLink>();
477                for (; results.hasNext();) {
478                        QuerySolution sol = results.next();
479                        Resource proForward = sol.getResource("pf");
480                        Resource proReverse = sol.getResource("pr");
481                        Resource cls = sol.getResource("c");
482                        Direction direction = null;
483                        String propURI = null;
484                        if (proForward != null) {
485                                if (proReverse != null) {
486                                        direction = Direction.both;
487                                } else {
488                                        direction = Direction.forward;
489                                }
490                                propURI = proForward.getURI();
491                        } else {
492                                direction = Direction.reverse;
493                                propURI = proReverse.getURI();
494                        }
495                        String clsURI = cls.getURI();
496                        // System.out.println(propURI + " " + clsURI + " " + direction);
497
498                        ClassLink cl = new ClassLink(propURI, clsURI, direction, 0);
499                        solCLs.add(cl);
500                }
501                qexec.close();
502                return solCLs.toArray(new ClassLink[0]);
503        }
504
505        public Path[] getPaths(String startClass, String endClass, int mode,
506                        boolean countLinks) throws Exception {
507                OWLClassGraph graph = new OWLClassGraph(startClass, endClass);
508                return graph.getPaths(this, mode, countLinks);
509        }
510
511        public String createSPARQL(Path path) throws Exception {
512                return null;
513        }
514
515        /*
516         * private String executeSelect(String sparqlQuery) throws Exception {
517         * HttpClient client = HttpClientBuilder.create().build(); HttpPost httppost
518         * = new HttpPost(endpointURI); httppost.setHeader("Content-Type",
519         * "application/x-www-form-urlencoded"); httppost.setHeader("Accept",
520         * "application/sparql-results+xml"); List<NameValuePair> nvpList = new
521         * ArrayList<NameValuePair>(); nvpList.add(new BasicNameValuePair("query",
522         * sparqlQuery)); // nvpList.add(new BasicNameValuePair("format", //
523         * outputFormat.getMime())); httppost.setEntity(new
524         * UrlEncodedFormEntity(nvpList, Charset .forName("UTF-8"))); HttpResponse
525         * response = client.execute(httppost); //
526         * System.out.println("[StatusLine] " + response.getStatusLine());
527         * HttpEntity entity = response.getEntity(); String entityString =
528         * EntityUtils.toString(entity, "UTF-8"); return entityString; }
529         */
530
531        /**
532         * 縲€謖�ｮ壹＆繧後◆繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ繧定ｵｷ轤ｹ縺ｨ縺励€√◎縺ｮ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｫ繝ｪ繝ｳ繧ｯ縺悟ｼｵ繧峨ｌ縺ｦ縺�ｋ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ髮�粋繧貞叙蠕励☆繧九€�
533         * 縲€蜿門ｾ励＆繧後◆蜷�う繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧らｶｲ鄒�噪縺ｫ蜿門ｾ励☆繧�
534         * <p>
535         * 縺薙％縺ｧ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ縺ｯ縲〉df:type縺ｮ荳ｻ隱槭→縺励※險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ゅ�繧偵＞縺�<br>
536         * 蜃ｦ逅�ｯｾ雎｡繝��繧ｿ繧暖raphURIs縺ｧ謖�ｮ壹☆繧九％縺ｨ縺後〒縺阪ｋ <br>
537         * </p>
538         *
539         * @param graphURIs
540         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� 縲€(null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
541         * @param originInstance
542         *            襍ｷ轤ｹ縺ｨ縺ｪ繧九う繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮURI縲€��ull荳榊庄��
543         * @param limit
544         *            隗｣縺ｨ縺励※霑斐＆繧後ｋInstanceLink驟榊�縺ｮ髟ｷ縺輔�荳企剞蛟､繧呈欠螳壹☆繧九€�荳企剞蛟､繧定ｨｭ螳壹＠縺ｪ縺�ｴ蜷医�0莉･荳九�蛟､繧呈欠螳壹☆繧�
545         * @return InstanceLink縺ｮ驟榊�縲ゅ％縺薙↓縺ｯ縲∝叙蠕励＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｨ髢｢菫ゅ▼縺代ｉ繧後※縺�ｋ繝励Ο繝代ユ繧｣縲�未菫ゅ�蜷代″縺悟性縺ｾ繧後ｋ縲�
546         * @throws Exception
547         * @since 28.01.2014
548         */
549        public InstanceLink[] getNextInstancesViaInstanceLink(String[] graphURIs,
550                        String originInstance, int limit) throws Exception {
551                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
552                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
553                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
554                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
555                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?pf ?pr ?ins ?c \n");
556                if (graphURIs != null) {
557                        for (String graphURI : graphURIs) {
558                                queryStr.append("FROM <");
559                                queryStr.append(graphURI);
560                                queryStr.append(">\n");
561                        }
562                }
563                queryStr.append("WHERE{\n");
564                // queryStr.append("  { ?c rdf:type rdfs:Class. }\n  UNION\n  { ?c rdf:type owl:Class. }\n");
565                queryStr.append("  ?ins rdf:type ?c.\n");
566                queryStr.append("  { ?ins ?pr <");
567                queryStr.append(originInstance);
568                queryStr.append(">. }\n  UNION { <");
569                queryStr.append(originInstance);
570                queryStr.append("> ?pf ?ins. }\n");
571
572                queryStr.append(" FILTER (?c != rdf:Property)");
573
574                queryStr.append("}\n");
575                if (limit > 0) {
576                        queryStr.append("limit ");
577                        queryStr.append(limit);
578                        queryStr.append("\n");
579                }
580
581                // System.out.println(queryStr.toString());
582
583                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
584                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
585                                query);
586
587                ResultSet results = qexec.execSelect();
588                HashMap<String, InstanceLink> insLinkMap = new HashMap<String, InstanceLink>();
589                for (; results.hasNext();) {
590                        QuerySolution sol = results.next();
591                        Resource proForward = sol.getResource("pf");
592                        Resource proReverse = sol.getResource("pr");
593                        Resource ins = sol.getResource("ins");
594                        Resource cls = sol.getResource("c");
595                        Direction direction = null;
596                        String propURI = null;
597                        if (proForward != null) {
598                                if (proReverse != null) {
599                                        direction = Direction.both;
600                                } else {
601                                        direction = Direction.forward;
602                                }
603                                propURI = proForward.getURI();
604                        } else {
605                                direction = Direction.reverse;
606                                propURI = proReverse.getURI();
607                        }
608                        String clsURI = cls.getURI();
609                        String insURI = ins.getURI();
610                        String key = propURI + "\t" + insURI + "\t" + direction;
611                        if (insLinkMap.containsKey(key)) {
612                                InstanceLink insLink = insLinkMap.get(key);
613                                insLink.addLinkedClassURI(clsURI);
614                        } else {
615                                InstanceLink insLink = new InstanceLink(propURI, insURI,
616                                                new String[] { clsURI }, direction);
617                                insLinkMap.put(key, insLink);
618                        }
619                }
620                qexec.close();
621                Collection<InstanceLink> values = insLinkMap.values();
622                return values.toArray(new InstanceLink[0]);
623        }
624
625        public LabelMap[] getLabels(String[] graphURIs, String[] resourceURIs,
626                        String language) throws Exception {
627                if (resourceURIs == null || resourceURIs.length == 0) {
628                        return new LabelMap[0];
629                }
630                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
631                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
632                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
633                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
634                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?res ?label \n");
635                if (graphURIs != null) {
636                        for (String graphURI : graphURIs) {
637                                queryStr.append("FROM <");
638                                queryStr.append(graphURI);
639                                queryStr.append(">\n");
640                        }
641                }
642                queryStr.append("WHERE{\n");
643                queryStr.append("  ?res rdfs:label ?label.\n");
644                queryStr.append("  FILTER(?res IN (");
645                boolean f = false;
646                for (String resourceURI : resourceURIs) {
647                        if (f) {
648                                queryStr.append(", ");
649                        }
650                        f = true;
651                        queryStr.append("<");
652                        queryStr.append(resourceURI);
653                        queryStr.append(">");
654                }
655                queryStr.append("))\n");
656                queryStr.append("}");
657
658                System.out.println(queryStr.toString());
659
660                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
661                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
662                                query);
663
664                ResultSet results = qexec.execSelect();
665                HashMap<String, LabelMap> lMap = new HashMap<String, LabelMap>();
666                for (; results.hasNext();) {
667                        QuerySolution sol = results.next();
668                        String uri = sol.getResource("res").getURI();
669                        Literal literal = sol.getLiteral("label");
670                        if (literal != null) {
671                                String label = literal.getString();
672                                String lang = literal.getLanguage();
673                                if (language != null && language.equals(lang)) {
674                                        Label lbl = new Label(label, lang);
675                                        if (lMap.containsKey(uri)) {
676                                                LabelMap lm = lMap.get(uri);
677                                                lm.addLabel(lbl);
678                                        } else {
679                                                LabelMap lm = new LabelMap(uri, new Label[] { lbl });
680                                                lMap.put(uri, lm);
681                                        }
682                                }
683                        }
684                }
685                return lMap.values().toArray(new LabelMap[0]);
686        }
687
688        public ClassLink[] countLinks(String[] graphURIs, String startClassURI,
689                        ClassLink[] classLinks) throws Exception {
690                if (classLinks == null || classLinks.length == 0) {
691                        return new ClassLink[0];
692                }
693                for (ClassLink classLink : classLinks) {
694                        StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
695                        queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
696                        queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
697                        queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
698
699                        queryStr.append("SELECT (COUNT(?os) AS ?numOfLinks) \n");
700                        if (graphURIs != null) {
701                                for (String graphURI : graphURIs) {
702                                        queryStr.append("FROM <");
703                                        queryStr.append(graphURI);
704                                        queryStr.append(">\n");
705                                }
706                        }
707
708                        queryStr.append("WHERE{\n");
709                        if (classLink.getDirection() == Direction.forward) {
710                                queryStr.append("?is rdf:type  <");
711                                queryStr.append(startClassURI);
712                                queryStr.append(">.\n");
713                                queryStr.append("?os rdf:type  <");
714                                queryStr.append(classLink.getLinkedClassURI());
715                                queryStr.append(">.\n");
716                                queryStr.append("?is ?p ?os.\n");
717                                queryStr.append("}");
718                        } else {
719                                if (classLink.getDirection() == Direction.forward) {
720                                        queryStr.append("?os rdf:type  <");
721                                        queryStr.append(startClassURI);
722                                        queryStr.append(">.\n");
723                                        queryStr.append("?is rdf:type  <");
724                                        queryStr.append(classLink.getLinkedClassURI());
725                                        queryStr.append(">.\n");
726                                        queryStr.append("?is ?p ?os.\n");
727                                        queryStr.append("}");
728                                } else {
729                                        queryStr.append("?os rdf:type  <");
730                                        queryStr.append(startClassURI);
731                                        queryStr.append(">.\n");
732                                        queryStr.append("?is rdf:type  <");
733                                        queryStr.append(classLink.getLinkedClassURI());
734                                        queryStr.append(">.\n");
735                                        queryStr.append("{?is ?p ?os.}\n");
736                                        queryStr.append("UNION\n");
737                                        queryStr.append("{?os ?p ?is.}\n");
738                                        queryStr.append("}");
739                                }
740                        }
741                        System.out.println(queryStr.toString());
742
743                        Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
744                        QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(
745                                        endpointURI, query);
746
747                        ResultSet results = qexec.execSelect();
748                        if (results.hasNext()) {
749                                QuerySolution sol = results.next();
750                                Literal lit = sol.getLiteral("numOfLinks");
751                                if (lit != null) {
752                                        int numOfLinks = lit.getInt();
753                                        classLink.setNumOfLinks(numOfLinks);
754                                }
755                        }
756                        qexec.close();
757                }
758                return classLinks;
759        }
760
761        public SClass[] countInstances(String[] graphURIs, SClass[] classes)
762                        throws Exception {
763                if (classes == null || classes.length == 0) {
764                        return new SClass[0];
765                }
766                HashMap<String, SClass> classMap = new HashMap<String, SClass>();
767                for (SClass sc : classes) {
768                        classMap.put(sc.getClassURI(), sc);
769                }
770                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
771                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
772                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
773                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
774                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?cls  (COUNT(?is) AS ?numOfInstances)\n");
775                if (graphURIs != null) {
776                        for (String graphURI : graphURIs) {
777                                queryStr.append("FROM <");
778                                queryStr.append(graphURI);
779                                queryStr.append(">\n");
780                        }
781                }
782                queryStr.append("WHERE{\n");
783                queryStr.append("  ?is rdf:type ?cls.\n");
784                queryStr.append("  FILTER(?cls IN (");
785                boolean f = false;
786                Set<String> clsSet = classMap.keySet();
787                for (String clsURI : clsSet) {
788                        if (f) {
789                                queryStr.append(", ");
790                        }
791                        f = true;
792                        queryStr.append("<");
793                        queryStr.append(clsURI);
794                        queryStr.append(">");
795                }
796                queryStr.append("))\n");
797                queryStr.append("} GROUP BY ?cls");
798
799                System.out.println(queryStr.toString());
800
801                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
802                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
803                                query);
804
805                ResultSet results = qexec.execSelect();
806                for (; results.hasNext();) {
807                        QuerySolution sol = results.next();
808                        String uri = sol.getResource("cls").getURI();
809                        SClass sc = classMap.get(uri);
810                        Literal lit = sol.getLiteral("numOfInstances");
811                        if (lit != null) {
812                                int numOfInstances = lit.getInt();
813                                sc.setNumOfInstances(numOfInstances);
814                        }
815                }
816                qexec.close();
817
818                return classes;
819        }
820
821}
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。