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| 5 | package org.biohackathon.SPARQLBuilder.OWL; |
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| 9 | * @author atsuko |
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| 11 | import java.util.*; |
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| 14 | public class LabeledMultiDigraph { |
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| 15 | List<List<LabeledEdge>> adjlist; |
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| 16 | List<String> labels; |
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| 17 | HashMap<String,Integer> labelednodes; |
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| 18 | List<Map<Integer,List<LabeledEdge>>> gadjlist; // grouped adj list: node, node-edge list |
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| 20 | public class LabeledEdge{ |
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| 21 | Integer node; |
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| 22 | Object label; |
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| 24 | public LabeledEdge(Integer node, Object label){ |
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| 25 | this.node = node; |
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| 26 | this.label = label; |
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| 27 | } |
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| 28 | |
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| 29 | public Object getLabel(){ |
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| 30 | return label; |
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| 31 | } |
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| 32 | } |
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| 33 | |
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| 34 | public LabeledMultiDigraph(){ |
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| 35 | adjlist = new ArrayList<List<LabeledEdge>>(); |
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| 36 | labels = new LinkedList<String>(); |
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| 37 | labelednodes = new HashMap<String, Integer>(); |
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| 38 | gadjlist = new ArrayList<Map<Integer,List<LabeledEdge>>>(); |
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| 39 | } |
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| 40 | |
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| 41 | public void addNode(String label){ |
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| 42 | labelednodes.put(label, labels.size()); |
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| 43 | labels.add(label); |
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| 44 | adjlist.add(new LinkedList<LabeledEdge>()); |
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| 45 | gadjlist.add(new HashMap<Integer, List<LabeledEdge>>()); |
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| 46 | } |
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| 47 | |
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| 48 | public void addEdge(Integer node1, Integer node2, Object elabel){ |
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| 49 | if ( labels.size() < node1 || labels.size() < node2 ){ |
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| 50 | System.err.println("Error for Edge Addition: No Node for the Edge"); |
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| 51 | return; |
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| 52 | } |
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| 53 | LabeledEdge edge = new LabeledEdge(node2, elabel); |
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| 54 | adjlist.get(node1).add(edge); |
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| 55 | |
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| 56 | Map<Integer, List<LabeledEdge>> edges = gadjlist.get(node1); |
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| 57 | List<LabeledEdge> sedge = edges.get(node2); |
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| 58 | if ( sedge == null ){ |
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| 59 | sedge = new LinkedList<LabeledEdge>(); |
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| 60 | edges.put(node2, sedge); |
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| 61 | } |
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| 62 | sedge.add(edge); |
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| 63 | } |
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| 64 | } |
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