root/SPARQLBuilderWWW/src/java/org/biohackathon/SPARQLBuilder/www/CLServlet.java @ 256

リビジョン 256, 7.0 KB (コミッタ: atsuko, 9 年 前)

外部OWL読み込みに対応するよう変更
行番号 
1/*
2 * To change this license header, choose License Headers in Project Properties.
3 * To change this template file, choose Tools | Templates
4 * and open the template in the editor.
5 */
6
7package org.biohackathon.SPARQLBuilder.www;
8
9import java.io.IOException;
10import java.io.PrintWriter;
11import java.util.*;
12import javax.json.*;
13import javax.servlet.ServletException;
14import javax.servlet.annotation.WebServlet;
15import javax.servlet.http.HttpServlet;
16import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
17import javax.servlet.http.HttpServletResponse;
18import javax.servlet.http.HttpSession;
19import org.biohackathon.SPARQLBuilder.OWL.*;
20
21/**
22 *
23 * @author atsuko
24 */
25@WebServlet(name = "CLServlet", urlPatterns = {"/clist"})
26public class CLServlet extends HttpServlet {
27
28    private static final String FILENAME = "cdata/";
29   
30    /**
31     * Processes requests for both HTTP <code>GET</code> and <code>POST</code>
32     * methods.
33     *
34     * @param request servlet request
35     * @param response servlet response
36     * @throws ServletException if a servlet-specific error occurs
37     * @throws IOException if an I/O error occurs
38     */
39    protected void processRequest(HttpServletRequest request, HttpServletResponse response)
40            throws ServletException, IOException {
41        response.setContentType("text/html;charset=UTF-8");
42        try (PrintWriter out = response.getWriter()) {
43            /* TODO output your page here. You may use following sample code. */
44            out.println("<!DOCTYPE html>");
45            out.println("<html>");
46            out.println("<head>");
47            out.println("<title>Servlet CLServlet</title>");           
48            out.println("</head>");
49            out.println("<body>");
50            out.println("<h1>Servlet CLServlet at " + request.getContextPath() + "</h1>");
51            out.println("</body>");
52            out.println("</html>");
53        }
54    }
55
56    // <editor-fold defaultstate="collapsed" desc="HttpServlet methods. Click on the + sign on the left to edit the code.">
57    /**
58     * Handles the HTTP <code>GET</code> method.
59     *
60     * @param request servlet request
61     * @param response servlet response
62     * @throws ServletException if a servlet-specific error occurs
63     * @throws IOException if an I/O error occurs
64     */
65    @Override
66    protected void doGet(HttpServletRequest request, HttpServletResponse response)
67            throws ServletException, IOException {
68        //processRequest(request, response);
69        response.setContentType("application/json;charset=UTF-8");
70        response.setHeader("Access-Control-Allow-Origin", "*");
71        response.setHeader("Access-Control-Allow-Methods", "GET");
72        response.setHeader("Access-Control-Allow-Headers", request.getHeader("Access-Control-Request-Headers"));
73        response.setHeader("Access-Control-Max-Age", "-1");     
74        PrintWriter out = response.getWriter();
75        String ep = request.getParameter("ep");
76        //
77       
78       
79        String classURI = request.getParameter("class");
80        HttpSession session = request.getSession();
81        QueryPathGenerator qpg = (QueryPathGenerator)session.getAttribute("qpg");
82        if ( qpg == null ){
83            qpg = new QueryPathGenerator();
84        }
85        SortedSet<String> sortedClasses = new TreeSet<String>(); // display + url
86        qpg.setSPARQLendpoint(ep);
87        //OWLClassGraph ocg = qpg.getOWLClassGraph();
88        if ( classURI != null ){
89            qpg.setOWLClassGraph(classURI);
90        }
91       
92        SClass[] classes = qpg.getClasses(null);
93        qpg.setClassLabels(classes);
94        for (int i = 0 ; i < classes.length; i++ ){
95            String uri = classes[i].getClassURI();
96            /*
97            //if ( ocg.getNumberOfEdge(uri) == 0 ){
98            //    continue;
99            //}
100            if ( classURI != null ){
101                if ( qpg.getOWLClassGraph().visitedNode(uri) == false ){
102                    continue;
103                }
104            }
105            Label[] labels = classes[i].getLabels();
106            String label = null;
107            for ( int j = 0 ; j < labels.length; j++ ){
108                if ( labels[j].getLanguage() == null ){
109                    label = labels[j].getLabel(); break;
110                }else if ( labels[j].getLanguage().equals("en") ){
111                    label = labels[j].getLabel(); break;
112                }
113            }
114            if ( label == null ){
115                qpg.getClassLabelfromExternal(uri);
116            }           
117            if ( label == null ){
118                String[] uris = uri.split("/");
119                String tmplabel = uris[uris.length-1];
120                String[] tmplabel2 = tmplabel.split("#");
121                label = tmplabel2[tmplabel2.length-1];
122            }
123            */
124            String label = qpg.getClassLabel(uri);
125            StringBuilder classbuilder = new StringBuilder(label);
126            classbuilder.append("  ");
127            classbuilder.append(classes[i].getNumOfInstances());
128            classbuilder.append("  ");
129            classbuilder.append(uri);
130            sortedClasses.add(classbuilder.toString());
131        }
132        JsonBuilderFactory jbfactory = Json.createBuilderFactory(null);
133        JsonArrayBuilder jab = jbfactory.createArrayBuilder();
134        Iterator<String> cit = sortedClasses.iterator();
135        List<String> tmpclasses = new LinkedList<String>();
136        JsonObjectBuilder job = jbfactory.createObjectBuilder();
137        while( cit.hasNext() ){
138            String classinfo = cit.next();
139            String[] data = classinfo.split("  ");
140            if (data.length != 3 ){
141                System.out.println("data is wrong?");
142            }
143            if (data[0].matches("^[0-9]*$")){
144                tmpclasses.add(classinfo);
145            }else{
146                job.add("uri", data[2]);
147                job.add("label", data[0]);
148                job.add("number", data[1]);
149                jab.add(job);
150            }
151        }
152        cit = tmpclasses.iterator();
153        while( cit.hasNext() ){
154            String classinfo = cit.next();
155            String[] data = classinfo.split("  ");
156            if (data.length != 3 ){
157                System.out.println("data is wrong?");
158            }
159            job.add("uri", data[2]);
160            job.add("label", data[0]);
161            job.add("number", data[1]);
162            jab.add(job);
163        }       
164        JsonArray ja = jab.build();
165        out.print(ja);
166    }
167
168    /**
169     * Handles the HTTP <code>POST</code> method.
170     *
171     * @param request servlet request
172     * @param response servlet response
173     * @throws ServletException if a servlet-specific error occurs
174     * @throws IOException if an I/O error occurs
175     */
176    @Override
177    protected void doPost(HttpServletRequest request, HttpServletResponse response)
178            throws ServletException, IOException {
179        processRequest(request, response);
180    }
181
182    /**
183     * Returns a short description of the servlet.
184     *
185     * @return a String containing servlet description
186     */
187    @Override
188    public String getServletInfo() {
189        return "Short description";
190    }// </editor-fold>
191
192}
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。