root/SPARQLBuilderWWW/src/java/org/biohackathon/SPARQLBuilder/www/SPServlet.java @ 136

リビジョン 136, 8.1 KB (コミッタ: wu, 10 年 前)

SPServlet basic functions finished
行番号 
1/*
2 * To change this license header, choose License Headers in Project Properties.
3 * To change this template file, choose Tools | Templates
4 * and open the template in the editor.
5 */
6
7package org.biohackathon.SPARQLBuilder.www;
8
9import java.io.IOException;
10import java.io.PrintWriter;
11import java.util.Iterator;
12import java.util.List;
13import java.util.logging.Level;
14import java.util.logging.Logger;
15import javax.servlet.ServletException;
16import javax.servlet.annotation.WebServlet;
17import javax.servlet.http.HttpServlet;
18import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
19import javax.servlet.http.HttpServletResponse;
20import org.biohackathon.SPARQLBuilder.OWL.*;
21import org.json.JSONArray;
22import org.json.JSONException;
23import org.json.JSONObject;
24
25//import javax.json.Json;
26
27/**
28 *
29 * @author atsuko
30 */
31@WebServlet(name = "SPServlet", urlPatterns = {"/sparql"})
32public class SPServlet extends HttpServlet {
33
34    /**
35     * Processes requests for both HTTP <code>GET</code> and <code>POST</code>
36     * methods.
37     *
38     * @param request servlet request
39     * @param response servlet response
40     * @throws ServletException if a servlet-specific error occurs
41     * @throws IOException if an I/O error occurs
42     */
43    protected void processRequest(HttpServletRequest request, HttpServletResponse response)
44            throws ServletException, IOException {
45        response.setContentType("text/html;charset=UTF-8");
46        try (PrintWriter out = response.getWriter()) {
47            /* TODO output your page here. You may use following sample code. */
48            out.println("<!DOCTYPE html>");
49            out.println("<html>");
50            out.println("<head>");
51            out.println("<title>Servlet SPServlet</title>");           
52            out.println("</head>");
53            out.println("<body>");
54            out.println("<h1>Servlet SPServlet at " + request.getContextPath() + "</h1>");
55            out.println("</body>");
56            out.println("</html>");
57        }
58    }
59
60    // <editor-fold defaultstate="collapsed" desc="HttpServlet methods. Click on the + sign on the left to edit the code.">
61    /**
62     * Handles the HTTP <code>GET</code> method.
63     *
64     * @param request servlet request
65     * @param response servlet response
66     * @throws ServletException if a servlet-specific error occurs
67     * @throws IOException if an I/O error occurs
68     */
69    @Override
70/*    protected void doGet(HttpServletRequest request, HttpServletResponse response)
71            throws ServletException, IOException {
72        processRequest(request, response);
73    }*/
74        protected void doGet(HttpServletRequest request, HttpServletResponse response)
75            throws ServletException, IOException {
76        //processRequest(request, response);
77        response.setContentType("application/json;charset=UTF-8");
78        PrintWriter out = response.getWriter();
79        String jpath = request.getParameter("jsonpath");
80        Path path = null;
81        try {
82            path = convertJ2Path(jpath);
83        } catch (JSONException ex) {
84            Logger.getLogger(SPServlet.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
85        }
86        String query = null;
87        try {
88            query = convertPath2SPARQL(path);
89        } catch (Exception ex) {
90            Logger.getLogger(SPServlet.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
91        }
92        out.print(query);
93    }
94
95   
96
97    /**
98     * Handles the HTTP <code>POST</code> method.
99     *
100     * @param request servlet request
101     * @param response servlet response
102     * @throws ServletException if a servlet-specific error occurs
103     * @throws IOException if an I/O error occurs
104     */
105    @Override
106    protected void doPost(HttpServletRequest request, HttpServletResponse response)
107            throws ServletException, IOException {
108        processRequest(request, response);
109    }
110
111    /**
112     * Returns a short description of the servlet.
113     *
114     * @return a String containing servlet description
115     */
116    @Override
117    public String getServletInfo() {
118        return "Short description";
119    }// </editor-fold>
120
121    private Path convertJ2Path(String jpath) throws JSONException{
122 
123       JSONObject object = new JSONObject(jpath);
124       String startClass = object.getJSONObject("startClassURI").toString();
125       int width = Integer.parseInt(object.getJSONObject("width").toString());
126       JSONArray classLinks = object.getJSONArray("classLinks");
127        JSONObject jsonObject;
128        List <ClassLink> list = null;
129       
130          for (int i=0;i<classLinks.length();i++)
131            {
132            jsonObject = classLinks.getJSONObject(i); 
133            String propertyURI = jsonObject.getJSONObject("propertyURI").toString();
134            String linkedClassURI = jsonObject.getJSONObject("linkedClassURI").toString();
135             String linkedLiteralDatatypeURI = jsonObject.getJSONObject("linkedLiteralDatatypeURI").toString();
136            int numOfLinks = Integer.parseInt(jsonObject.getJSONObject("numOfLinks").toString());
137            int numOfLinkedInstances = Integer.parseInt(jsonObject.getJSONObject("numOfLinkedInstances").toString());
138            int numOfOriginInstances = Integer.parseInt(jsonObject.getJSONObject("numOfOriginInstances").toString());
139            int numOfOriginClassInstances = Integer.parseInt(jsonObject.getJSONObject("numOfOriginInstances").toString());           
140            int numOfLinkedClassInstances = Integer.parseInt(jsonObject.getJSONObject("numOfLinkedClassInstances").toString());
141           
142            ClassLink classLink =new ClassLink(propertyURI, linkedClassURI, linkedLiteralDatatypeURI, null,
143                                 numOfLinks,  numOfOriginInstances,  numOfLinkedInstances,
144                                 numOfOriginClassInstances,  numOfLinkedClassInstances,
145                                false, false);
146           list.add(classLink);
147           }
148          Path path = new Path(startClass,  list,  width);
149          return path;
150    }
151 
152    private String convertPath2SPARQL(Path path) throws Exception{
153        if( path == null ){
154                        throw new Exception("Path is null.");
155                }
156                String startClass = path.getStartClass();
157                List<ClassLink> classLinks = path.getClassLinks();
158               
159                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
160                StringBuffer selStr = new StringBuffer();
161                StringBuffer whereStr = new StringBuffer();
162        //      if(num==0){
163                        int num = classLinks.size();
164        //      }
165                       
166                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
167                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
168                               
169                selStr.append("SELECT ");
170                whereStr.append("WHERE { \n");
171
172                String properties = null;
173                String objectClasses = null;
174                String subjectClasses = null;
175                Direction direction = null;
176                int i = 0;
177                int k = 0;
178                for (ClassLink link :classLinks )
179                {
180                        properties = link.getPropertyURI();
181                        objectClasses = link.getLinkedClassURI();
182                        direction = link.getDirection();
183                       
184                        if (i==0)
185                    subjectClasses = startClass;
186                       
187                        selStr.append("?c").append(i).append(" ");
188                        selStr.append("?l").append(i).append(" ");
189                       
190                        if(i == classLinks.size())
191                                selStr.append("\n");
192                       
193                       
194                        whereStr.append("?c").append(i).
195                        append(" rdf:type ").
196                        append("<").
197                        append(subjectClasses).
198                        append(">").
199                        append(".\n");
200                       
201                        whereStr.append("OPTIONAL{\n?c"+i+" rdfs:label ?l"+i+".}\n");
202
203                                               
204                        if(direction == Direction.forward)
205                        {
206                        whereStr.append("?c").append(i).append(" ");
207                        whereStr.append("<").append(properties).append("> ");                   
208                        whereStr.append("?c").append(i+1).append(".\n");                       
209                        }
210                        else
211                        {
212                                whereStr.append("?c").append(i+1).append(" ");
213                                whereStr.append("<").append(properties).append("> ");
214                                whereStr.append("?c").append(i).append(".\n");
215                        }
216                       
217                        subjectClasses = objectClasses;
218                        i++;
219                        k++;
220                        if(k>=num){
221                                break;
222                        }
223                }
224               
225                selStr.append("?c").append(i).append(" \n");
226                selStr.append("?l").append(i).append(" \n");
227                whereStr.append("?c").append(i).append(" rdf:type ").
228                    append("<").
229                    append(subjectClasses).
230                    append(">").
231                        append(".\n");
232                whereStr.append("OPTIONAL{\n?c"+i+" rdfs:label ?l"+i+".}\n");
233       
234                                       
235                queryStr.append(selStr).append(whereStr);
236               
237                queryStr.append("}");
238                //OPTIONAL
239                queryStr.append("LIMIT 100\n");;
240               
241                //System.out.println(queryStr);
242                return queryStr.toString();
243       
244   
245    }
246}
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。