root/galaxy-central/templates/dataset/edit_attributes.mako

リビジョン 2, 8.6 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1<%inherit file="/base.mako"/>
2<%namespace file="/message.mako" import="render_msg" />
3
4<%def name="title()">${_('Edit Dataset Attributes')}</%def>
5
6<%def name="stylesheets()">
7    ${h.css( "base", "autocomplete_tagging" )}
8</%def>
9
10<%def name="javascripts()">
11    ${parent.javascripts()}
12    ${h.js( "galaxy.base", "jquery.autocomplete", "autocomplete_tagging" )}
13</%def>
14
15<%def name="datatype( dataset, datatypes )">
16    <select name="datatype">
17        %for ext in datatypes:
18            %if dataset.ext == ext:
19                <option value="${ext}" selected="yes">${_(ext)}</option>
20            %else:
21                <option value="${ext}">${_(ext)}</option>
22            %endif
23        %endfor
24    </select>
25</%def>
26
27%if message:
28    ${render_msg( message, status )}
29%endif
30
31<div class="toolForm">
32    <div class="toolFormTitle">${_('Edit Attributes')}</div>
33    <div class="toolFormBody">
34        <form name="edit_attributes" action="${h.url_for( controller='root', action='edit' )}" method="post">
35            <input type="hidden" name="id" value="${data.id}"/>
36            <div class="form-row">
37                <label>
38                    Name:
39                </label>
40                <div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
41                    <input type="text" name="name" value="${data.get_display_name()}" size="40"/>
42                </div>
43                <div style="clear: both"></div>
44            </div>
45            <div class="form-row">
46                <label>
47                    Info:
48                </label>
49                <div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
50                    <input type="text" name="info" value="${data.info}" size="40"/>
51                </div>
52                <div style="clear: both"></div>
53            </div>
54            %if trans.get_user() is not None:
55                <div class="form-row">                   
56                    <label>
57                        Annotation / Notes:
58                    </label>
59                    <div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
60                        <textarea name="annotation" cols="40" rows="2">${data_annotation}</textarea>
61                    </div>
62                    <div style="clear: both"></div>
63                    <div class="toolParamHelp">Add an annotation or notes to a dataset; annotations are available when a history is viewed.</div>
64                </div>
65            %endif
66            %for name, spec in data.metadata.spec.items():
67                %if spec.visible:
68                    <div class="form-row">
69                        <label>
70                            ${spec.desc}:
71                        </label>
72                        <div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
73                            ${data.metadata.get_html_by_name( name, trans=trans )}
74                        </div>
75                        <div style="clear: both"></div>
76                    </div>
77                %endif
78            %endfor
79            <div class="form-row">
80                <input type="submit" name="save" value="${_('Save')}"/>
81            </div>
82        </form>
83        <form name="auto_detect" action="${h.url_for( controller='root', action='edit' )}" method="post">
84            <input type="hidden" name="id" value="${data.id}"/>
85            <div class="form-row">
86                <div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
87                    <input type="submit" name="detect" value="${_('Auto-detect')}"/>
88                </div>
89                <div class="toolParamHelp" style="clear: both;">
90                    This will inspect the dataset and attempt to correct the above column values if they are not accurate.
91                </div>
92            </div>
93        </form>
94        %if data.missing_meta():
95            <div class="form-row">
96                <div class="errormessagesmall">${_('Required metadata values are missing. Some of these values may not be editable by the user. Selecting "Auto-detect" will attempt to fix these values.')}</div>
97            </div>
98        %endif
99    </div>
100</div>
101<p />
102<% converters = data.get_converter_types() %>
103%if len( converters ) > 0:
104    <div class="toolForm">
105        <div class="toolFormTitle">${_('Convert to new format')}</div>
106        <div class="toolFormBody">
107            <form name="convert_data" action="${h.url_for( controller='root', action='edit' )}" method="post">
108                <input type="hidden" name="id" value="${data.id}"/>
109                <div class="form-row">
110                    <div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
111                        <select name="target_type">
112                            %for key, value in converters.items():
113                                <option value="${key}">${value.name}</option>
114                            %endfor
115                        </select>
116                    </div>
117                    <div class="toolParamHelp" style="clear: both;">
118                        This will create a new dataset with the contents of this dataset converted to a new format.
119                    </div>
120                    <div style="clear: both"></div>
121                </div>
122                <div class="form-row">
123                    <input type="submit" name="convert_data" value="${_('Convert')}"/>
124                </div>
125            </form>
126        </div>
127    </div>
128    <p />
129%endif
130
131<div class="toolForm">
132    <div class="toolFormTitle">${_('Change data type')}</div>
133    <div class="toolFormBody">
134        %if data.datatype.allow_datatype_change:
135            <form name="change_datatype" action="${h.url_for( controller='root', action='edit' )}" method="post">
136                <input type="hidden" name="id" value="${data.id}"/>
137                <div class="form-row">
138                    <label>
139                        ${_('New Type')}:
140                    </label>
141                    <div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
142                        ${datatype( data, datatypes )}
143                    </div>
144                    <div class="toolParamHelp" style="clear: both;">
145                        ${_('This will change the datatype of the existing dataset but <i>not</i> modify its contents. Use this if Galaxy has incorrectly guessed the type of your dataset.')}
146                    </div>
147                    <div style="clear: both"></div>
148                </div>
149                <div class="form-row">
150                    <input type="submit" name="change" value="${_('Save')}"/>
151                </div>
152            </form>
153        %else:
154            <div class="form-row">
155                <div class="warningmessagesmall">${_('Changing the datatype of this dataset is not allowed.')}</div>
156            </div>
157        %endif
158    </div>
159</div>
160<p />
161
162%if trans.app.security_agent.can_manage_dataset( current_user_roles, data.dataset ):
163    <%namespace file="/dataset/security_common.mako" import="render_permission_form" />
164    ${render_permission_form( data.dataset, data.get_display_name(), h.url_for( controller='root', action='edit', id=data.id ), all_roles )}
165%elif trans.user:
166    <div class="toolForm">
167        <div class="toolFormTitle">View Permissions</div>
168        <div class="toolFormBody">
169            <div class="form-row">
170                %if data.dataset.actions:
171                    <ul>
172                        %for action, roles in trans.app.security_agent.get_permissions( data.dataset ).items():
173                            %if roles:
174                                <li>${action.description}</li>
175                                <ul>
176                                    %for role in roles:
177                                        <li>${role.name}</li>
178                                    %endfor
179                                </ul>
180                            %endif
181                        %endfor
182                    </ul>
183                %else:
184                    <p>This dataset is accessible by everyone (it is public).</p>
185                %endif
186            </div>
187        </div>
188    </div>
189%endif
190<p/>
191<div class="toolForm">
192    <div class="toolFormTitle">Copy History Item</div>
193        <div class="toolFormBody">
194            <form name="copy_hda" action="${h.url_for( controller='dataset', action='copy_datasets', source_dataset_ids=data.id, target_history_ids=data.history_id )}" method="post">
195                <div class="form-row">
196                    <input type="submit" name="change" value="Copy history item"/>
197                    <div class="toolParamHelp" style="clear: both;">
198                        Make a copy of this history item in your current history or any of your active histories.
199                    </div>
200                </div>
201            </form>
202        </div>
203    </div>
204</div>
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。